由人类思维与情感产生的"e-Pulse"，被当作AI支援装置"萨波塔玛"的能量源来使用。在科技飞速发展的背后，出现了可怕的怪物—— 以e-Pulse为食并不断进化的生命体"数码兽"。天马智郎因突然从萨波塔玛中现身的壁虎兽而卷入非日常。在与以赏金为业的"黄金黎明"团队——泽城京等人共同生活的过程中，智郎重新坚定了决心。人类与数码兽将描绘出怎样的全新未来…
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